درست است که پدر آقای علی خامنه‌ای زادۀ آذربایجان بود، اما برپایۀ زندگی‌نامه های متعددی که دربارۀ او و خانواده اش به چاپ رسیده، جد پدری خامنه ای اهل تفرش بود. خود خامنه ای زادۀ مشهد است و مادرش، دختر آیت‌الله هاشم میردامادی اهل اصفهان بود که در مشهد ساکن شده بود.